המרכז נוסד בשנת 1977 בראשותו של פרופ' ירמיהו יובל לעידוד המחקר הפילוסופי באוניברסיטה.
כיום יו"ר המרכז פרופ' דני אטאס ומנהלו ד"ר איתי ניסן-רוזן.
המרכז מוציא לאור את הרבעון הפילוסופי עיון, וכן מקיים ימי עיון וסימפוזיונים, בהם מפגשי ירושלים בפילוסופיה, שהם כנסים בינלאומיים המוקדשים לנושאים שונים בפילוסופיה.